2006 var ett glädjande år, både ekonomiskt och sportsligt för Hammarby Fotboll. Koncernen Hammarby Fotboll AB gör ett resultat på 5.401.000 kronor efter finansnetto, vilket innebär rekordresultat för koncernen. Omsättningen ökar med nästan 20 miljoner kronor til 90.739.000 kronor. Det egna kapitalet uppgår till 10.021.000 kronor i koncernen. Hammarby Fotboll AB har sedan företagsbildandet visat på en mycket stabil ekonomi där det egna kapitalet i det närmaste är intakt.

Hammarby Fotboll AB ökar sina intäkter på flera områden, bl a ökar marknadsintäkterna från 42 msek till 48 msek. Publiksnittsrekordet på Söderstadion ökade också till 11.793 åskådare. Det är högsta publiksiffran för en hel säsong på Söderstadion.

Sportsligt var 2006 också ett bra år för Hammarby Fotboll. A-laget kom trea i Allsvenskan och fick därmed lilla silvret, samarbetsklubben Hammarby Talangfotbollförening slutade sjua i Division 2 östra Svealand och Juniorlaget gick till slutspel.
Hammarby Fotboll AB:s majoritetsägare, Hammarby IF Fotbollförening, visar också ett positivt resultat för 2006 på 266.000 kronor och i föreningen uppgår det egna kapitalet till 2,3 miljoner kronor.

På den sportsliga sidan visade P16-laget stor klass och vann SM-guld. Det gick genom det pojkallsvenska seriespelet och slutspelet helt obesegrade. Laget spelade 22 matcher i serien, varav man vann 20 och spelade 2 oavgjorda. Målskillnaden blev 80-16.

Totalt deltog 750 spelare och 150 ledare fördelade på 37 träningstrupper i åldersspannen 6-16 år, i Hammarby Fotbollförenings verksamhet.

Hammarby Akademi fortsatte att utvecklas under 2006 med hjälp av Allmänna arvsfonden. Hammarby Akademi finns för att unga spelare ska kunna kombinera fotbollsträning på elitnivå med studier och därmed inte behöva offra studieresultaten för att orka med fotbollen. I Gubbängsskolan antogs 70 elever och ytterligare 70 elever antas till hösten 2007. I Botkyrka engagerar Hammarby Akademi 160 spelare i Fittjaängsskolan och i S:t Botvids gymnasium. Erkan Zengin och Sebastian Castro-Tello är två lyckosamma spelarexempel från Botkyrka. Dessutom inleddes under 2006 projekteringen av gymnasieintagningar till Fredrika Bremer-gymnasierna i Haninge. Det projektet presenterades tidigt under 2007 och gymnasieintagningar sker till hösten samma år.